私見による、今現在残っている問題点

ドワンゴと将棋連盟が、24点法への対応強要について釈明していない

棋士の研究が無駄になる可能性がある24点法への変更強要について、何も説明していません。
ニコ生でもNGワードにされ、あからさまに隠したいという態度が見えます。
第一局の菅井五段の対局では、菅井五段が今まで打たれたことの無い手を打たれ、動揺したと語っています。
これは24点法への対応が原因なのではないでしょうか？
もしそうだとしたら、全ソフトがレギュレーション違反で、もはや電王トーナメント入賞ソフトとプロ棋士の対戦という前提が崩れています。
※Ponanzaは24点法への対応を断ったそうです